#11 — installazione software bender

State	Resolved
Area	Annotation of Functional Elements
Issue type	Technical Support
Severity	Medium
Submitted by	Roberto Sirica
Submitted on	May 28, 2014
Responsible	Mario Aversano

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Ciao Mario, potresti installare su Bender i seguenti programmi?

https://github.com/szpiech/selscan Selscan
http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html pamlX-1.2+paml4.7-win32.tgz

grazie mille
Roberto Sirica

Added by Mario Aversano on May 28, 2014 05:25 PM

Issue state: Unconfirmed → Resolved

Responsible manager: (UNASSIGNED) → aversano

I software sono stati installati e possono essere lanciati da qualunque lama di bender da riga di comando.

Di Paml non ho potuto installare la shell grafica perchè linkata con una versione antica di qt incompatibile con quella attuale di bender.
Pero i seguenti programmi a riga di comando della suite paml:
baseml basemlg chi2 codeml evolver pamp yn00

Funzionano tutti.

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