#16 — miRNA profile analysis & Diana tools
State | Resolved |
---|---|
Area | Annotation of Functional Elements |
Issue type | Fast question |
Severity | Medium |
Submitted by | Capellona70 |
Submitted on | Jul 07, 2014 |
Responsible | Roberta Esposito |
Ciao,
qualcuno ha esperienza di analisi comparative tra miRNA profiling e mRNA profiling?
Sul sito della Diana tools (che mette a disposizione algoritmi per la prediction dei targets dei miR e altro) ho trovato un tool molto interessante:http:
//diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/index.php?r=site/help&topic=taverna.
Scaricando il software Taverna e il plugin di Diana tool, si possono utilizzare o creare workflow per analizzare risultati di microrray di miRNA (ricerca di targets) e confrontarli con il profilo di espressione (mRNA microarray) per poi fare ontology o pathway analysis o altro.
Ho installato software e plugin, però non riesco ad utilizzarli perché non ho capito come caricare i data-sets, che nel mio caso sono liste di Gene Name o miR name (da Excel).
Qualcuno può darmi una mano?
Grazie in anticipo e in ogni caso.
Laura Casalino
qualcuno ha esperienza di analisi comparative tra miRNA profiling e mRNA profiling?
Sul sito della Diana tools (che mette a disposizione algoritmi per la prediction dei targets dei miR e altro) ho trovato un tool molto interessante:http:
//diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/index.php?r=site/help&topic=taverna.
Scaricando il software Taverna e il plugin di Diana tool, si possono utilizzare o creare workflow per analizzare risultati di microrray di miRNA (ricerca di targets) e confrontarli con il profilo di espressione (mRNA microarray) per poi fare ontology o pathway analysis o altro.
Ho installato software e plugin, però non riesco ad utilizzarli perché non ho capito come caricare i data-sets, che nel mio caso sono liste di Gene Name o miR name (da Excel).
Qualcuno può darmi una mano?
Grazie in anticipo e in ogni caso.
Laura Casalino
Added by
Roberta Esposito
on
Jul 09, 2014 07:45 PM
Cara Laura,Spero di poterti aiutare. Magari vediamoci di persona.
Contattami domani al 617.
Roberta Esposito
Added by
Roberta Esposito
on
Jul 10, 2014 05:07 PM
Responsible manager:
(UNASSIGNED)
→
espositor
Added by
Roberta Esposito
on
Jul 21, 2014 05:34 PM
Issue state:
Unconfirmed
→
Resolved
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