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#16 — miRNA profile analysis & Diana tools

State Resolved
Area Annotation of Functional Elements
Issue type Fast question
Severity Medium
Submitted by Capellona70
Submitted on Jul 07, 2014
Responsible Roberta Esposito
Ciao,
qualcuno ha esperienza di analisi comparative tra miRNA profiling e mRNA profiling?

Sul sito della Diana tools (che mette a disposizione algoritmi per la prediction dei targets dei miR e altro) ho trovato un tool molto interessante:http:
//diana.imis.athena-innovation.gr/DianaTools/index.php?r=site/help&topic=taverna.

Scaricando il software Taverna e il plugin di Diana tool, si possono utilizzare o creare workflow per analizzare risultati di microrray di miRNA (ricerca di targets) e confrontarli con il profilo di espressione (mRNA microarray) per poi fare ontology o pathway analysis o altro.

Ho installato software e plugin, però non riesco ad utilizzarli perché non ho capito come caricare i data-sets, che nel mio caso sono liste di Gene Name o miR name (da Excel).

Qualcuno può darmi una mano?


Grazie in anticipo e in ogni caso.

Laura Casalino
Added by Roberta Esposito on Jul 09, 2014 07:45 PM
Cara Laura,
Spero di poterti aiutare. Magari vediamoci di persona.
Contattami domani al 617.

Roberta Esposito
Added by Roberta Esposito on Jul 10, 2014 05:07 PM
Responsible manager: (UNASSIGNED)espositor
Added by Roberta Esposito on Jul 21, 2014 05:34 PM
Issue state: UnconfirmedResolved

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